巴西是全世界生物多样性最高的国家，亚马孙雨林对此贡献巨大。亚马孙雨林每平方千米内的物种数量比整个欧洲的物种总量还多，甚至亚洲和非洲的热带雨林也无法达到亚马孙雨林那么高的生物多样性。生物多样性的意义广泛而深远：每一个物种都代表了一种适应自然的解决方案;每一个物种都直接影响其他物种的生存;每一个物种都具有造福人类的潜力。亚马孙雨林也是文化多样性的宝库。这里生活着许多原始部落，他们使用的语言、传承的艺术和生活方式，以及他们携带的基因，都是研究人类起源和迁移的宝贵材料。
雨林植物垂直分布
多生态位 在雨林中，阳光几乎完全被连续的冠层（乔木树冠形成的稠密顶层）吸收，因此植物采用各种绝招获取阳光。桃花芯木可以生长到50～60米高，这些高大乔木能够穿透平均高度为25～30米的冠层，依靠高度获取充足日照。在冠层之下，阔叶灌木的巨大叶片让这些灌木在阴暗的林下也能尽量吸收阳光。最底层的小型植物分到的日照最少，因此它们的叶片和地面呈同一个倾斜角度。这是一种共赢的生存方式——既保证了自己所需的日照，也给了位于其下方的植物一定的光照。
合作关系 如果没有兰花蜂授粉，巴西坚果（俗称鲍鱼果）树的花朵就不能受精结果。如果没有刺豚鼠这种大型啮齿动物，巴西坚果树就无法将种子传播到更远的地方。
文化多样性 亚马孙雨林的原始部落主要以狩猎、采集和捕鱼为生。一些原始部落还坚持进行轮作等可持续小规模农业生产，这被当地人称为“永续农业”。亚马孙雨林的奇特生物
南美提灯虫 这种昆虫头部就像是一个带壳的花生。“花生头”虽然恐怖，却无法撕咬。南美提灯蟲的口器像一根吸管，这种昆虫靠吸食植物汁液存活。科学家猜测，南美提灯虫头部是模仿蜥蜴头部，用于吓走一些掠食者。同时它翅膀上两个眼睛一样的图案也可以起到恐吓作用。如果恐吓达不到目的，它还会喷出难闻的液体。
猴锅树 玉蕊科的猴锅树和巴西坚果树是“亲戚”。和巴西坚果树一样，猴锅树的果实外形像椰子，但成熟后猴锅树的果实下部会掉落，变成一口倒扣过来的“锅”。雨林中的猴子非常喜欢猴锅树富含油脂的种子。猴锅果的开口很小，没有经验的小猴子在抓住种子后很难将手拔出来，只有经验丰富的老猴子懂得用指头每次少量取出种子。
玻璃蛙 玻璃蛙之所以得名，是因为它们的腹部几乎完全透明，腹腔内的器官、骨骼和血管清晰可见。玻璃蛙多为浅绿色，这有助于它们隐藏在绿色植物中。科学家至今已发现了60多种玻璃蛙。
皇狨猴 皇狨猴的下颌部长有长长的白色卷毛。皇狨猴是杂食性动物，主要吃果实、昆虫和树汁，有时也会吃鸟蛋和小型脊椎动物。成年皇狨猴体长一般为70厘米，体重不超过400克。
亚马孙河豚 亚马孙河豚，也称亚马孙粉色河豚，是一种淡水豚，在整个亚马孙盆地的河流中都有分布，一共有数万头。然而，在亚马孙河上修建的水坝将河流隔断，再加上水体污染，严重威胁到一些种群生存。
皇霸鹟 皇霸鸫是一种小型鸣禽，捕捉飞行昆虫为食。它头上的羽冠在靠近头部的区域为黄色，最外侧为蓝色，中间点缀着许多黑点。皇霸鹟有四个种，砍伐和焚烧森林导致其中两种成为濒危物种。
重要药物来源 亚马孙雨林是重要的药物原材料来源地。在亚马孙盆地和安第斯山脉，共有40多种树木的树皮中含有能有效治疗疟疾的奎宁。亚马孙雨林中生长的浸膏箭毒中含有筒箭毒碱，这种生物碱可以有效阻断肌肉神经信号传递，是一种强效肌肉松弛剂，曾经被用于临床治疗破伤风和狂犬病等疾病。
降压药物卡托普利被认为是高血压治疗药物研发上的一大突破，其中的有效成分就是蛇毒中某些化合物的衍生物。1933年，巴西药理学家席尔瓦在协助治疗一名被蝮蛇咬伤的患者时发现，无论使用什么升压药物都无法让伤者恢复血压。他意识到蛇毒中肯定有能够降压的成分。研究证实蛇毒中含有能扩张血管的“缓激肽”，以及一种能防止缓激肽被酶降解的缓激肽增强因子。今天，全世界每年有数百万高血压患者靠卡托普利稳定血压。
美国国家癌症研究院的一份报告指出，在所有被认为具有抗癌潜力的植物中，70%是亚马孙雨林独有种。大约1/4的抗癌药物的有效成分来自亚马孙植物，例如猫爪草、亚马孙龙血树和刺果番荔枝。雨林生物多样性之谜
为什么热带（尤其是亚马孙雨林）生活着如此众多的生物？两百多年来，对亚马孙雨林生物多样性极高的解释众说纷纭。美国石溪大学对全球123个树蛙栖息地进行数据比对后发现，亚马孙雨林的树蛙多样性高不仅得益于那里潮湿的热带气候和与之带来的森林高生产力，更在于雨林保留了更古老的树蛙品种。雨林中不同区域的树蛙多样性也不同：在树蛙多样性最高的区域，可以发现许多起源于6000多万年前的树蛙品种;而在树蛙多样性较低的区域，则几乎都是出现年代较晚的树蛙品种。
亚马孙雨林曾经经历过多次海平面变化、冰川进退和其他因素造成的地理隔离，从而导致新物种诞生。这种地理隔离在今天的亚马孙雨林依然不断上演：雨林中的河道时常改道或流量增加，这很容易形成新的地理隔离，从而形成新物种。同时，雨林中存在湖泊、沼泽、河流、开放地面和森林等多样化的地形;再加上各种高度的栖息地，让食物来源、小环境和天敌种类十分多样。这些因素共同造就了亚马孙雨林极高的生物多样性。（责任编辑 王川）
亚马孙雨林有丰富的树蛙品种。
今天的南美洲依然有大量冰川。亚马孙雨林曾经也被冰川覆盖过。
