陈霞 丁劲峰
摘 要:短串联重复序列(short tandem repeat,STR)又称微卫星DNA(micro satellite DNA),是一类广泛存在于人类基因组中的DNA多态性基因座。它由2-6碱基对构成核心序列,呈串联重复排列。STR基因位点长度一般在100~300bp之间。因个体间DNA片断长度或DNA序列差异而成高度多态性,在基因传递过程中遵循孟德尔共显性方式遗传。因其基因片段短、扩增效率高、判型准确等特点,已广泛应用于法医学个体识别和亲子鉴定等领域。该文报道在法医物证鉴定实践过程中一例2个STR基因突变的单亲亲子鉴定,目前这两个位点突变的报道尚不多,以期在后续实践过程中提供更多有研究价值的参考。
关键词:法医物证学 STR Y染色体 突变
中图分类号:D919 文献标识码:A 文章编号:1672-3791(2020)06(a)-0187-02
1 案例
1.1 简要案情
因公安户籍登记需要,基层派出所委托本鉴定机构对自称是孩子父亲的男子(31岁)与孩子(报4月龄)进行亲子鉴定,孩子生母2月前离家出走,下落不明。按照规范采集两者指尖末梢血样。
1.2 检验结果
采用Identifiler-PLUS试剂盒(美国)直接扩增检测,发现二者在D3S1358等位基因座不符合遗传规律,取平均突变率u=0.002[1],按照司法部亲权鉴定技术规范(SF/Z JD0105001-2010)(以下简称规范)及公安部法庭科学DNA亲子鉴定规范(GA/T 965-2011),计算CPI值为214.2019,达不到认定父权的标准,但也不能排除。根据规范要求,采用AGCU Expressmarker 22试剂盒(无锡中德美联)重新检测常染色体STR检测,并采用AGCU 21+1 STR试剂盒(无锡中德美联)增加常染色体位点检测,并用Yfier Direct试剂盒(美国)进行二者Y-STR检测,在已检测的39个常染色体STR及16个Y-STR中,发现D3S1358、D17S301两个等位基因座不符合遗传规律。
按规范对突变基因座进行亲权指数(PI)、累积亲权指数(CPI)和亲权概率(W)计算[2]。各STR基因座分型结果和PI值计算结果见表1。
2 讨论
STR突变是DNA在复制过程中,DNA聚合酶发生滑脱导致核心序列重复次数发生改变所致,中国人常用的STR基因座平均突变率为0%~0.492%[3]。因为STR基因突变比较罕见,两个等位基因同时突变的发生的概率更低,但在以往文献报道中也是有出现,此例中疑父与小孩有2个常染色体不符合遗传规律,且经一步突变均可形成,即D3S1358基因座,疑父为18,小孩为17,D17S301位点,疑父为13,小孩为12,但生母未参与鉴定的情况,报道较少,认定难度较大[4,5]。
亲子鉴定中,仅有少数STR(通常1~2个)基因座违反遗传规律时,通常要考慮是突变,还是近亲干扰。当疑父与孩子的生父具有较近的血缘关系时,应避免错误认定父权的风险。在排除近亲及双胞胎的前提下,当父亲与孩子在基因遗传中确实出现基因突变时,应避免出现错误排除父权的风险。
根据规范要求,若有基因座不符合孟德尔遗传规律,不能为了获得较高的PI值,将检测到的不符合遗传规律的遗传标记删除,应该增加检测STR基因座的数量,也可以通过补充小孩母亲样本,确定突变来源。如鉴定父子关系时,可增加检测Y染色体遗传标记,在鉴定母女关系时,可以增加检测线粒体DNA(mt-DNA)遗传标记,但其基因频率不能采用概率累乘,所有的全部线粒体DNA(mt-DNA)基因座应作为一个整体,用其单倍型频率带入计算。综合分析得出意见。
此例中,在常规检测发现一个STR基因座不符合遗传规律,在小孩生母无法提供样本的情况下,通过增加常染色体STR位点及Y-STR基因座的检测,虽又发现D17S301等位基因不符合遗传规律,但计算CPI,已达到认定亲权的标准,故基于目前已知的条件和DNA检测结果,支持被检测男子和孩子存在亲缘关系。
综上,STR基因座违反遗传规律的案例虽少见,但已为人们所关注,在个别STR基因座违反遗传规律的案例应该谨慎对待,可要求生母参与鉴定及增加检测基因座,计算CPI值,按规范标准判定,必要时还应及时与委托单位或者被鉴定人进行沟通,了解其个人与家庭成员情况,尽可能避免鉴定差错。
参考文献
[1] 刘秋玲,伍新尧,吕德坚,等.亲子鉴定中2个STR基因座突变1例[J].中国法医学杂志,2001,16(4):238-239.
[2] 郑秀芬.法医DNA分析[M].北京:中国人民公安大学出版社,2002:727.
[3] 李海霞.孙宏钰.3个STR基因座同时突变的亲子鉴定案1例[J].中国法医学杂志,2009,25(4):319-320.
[4] 陈勇,孙宏钰,伍新尧,等.亲子鉴定中3个STR基因座存在变异分析1例[J].法医学杂志,2003,19(3):188-189.
[5] 毕洁,李妙霞.2个STR基因座突变亲子鉴定1例[C]//全国第九次法医学术交流会论文集.2013:156-157.